学校心理咨询服务不同于医院的心理咨询门诊工作，它不可能包治学生中的各种心理障碍和疾病，对于一些有严重心理疾病的学生，咨询人员要及时发现，并立刻转介给医院的心理治疗门诊及时治疗，以免贻误治疗时机。尽管学生中精神分裂症比较少，但咨询员在工作中如发现有幻觉、妄想和严重意识、行为障碍的学生，应该立即上报心理健康领导小组，并向各系院通报，由各系院通知学生家长，由家属陪同去精神病医疗机构求诊或咨询。另外，学生中常见的各种心身疾病，如：神经性厌食症、胃肠神经官能症、神经性呕吐等疾病，在咨询中如有发现，不可轻易下结论，应建议转介综合性医院进行全面的医疗诊断，以免贻误可能的器质性病变的诊断与治疗。